Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znrf3Q5SSZ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Znrf3Q5SSZ7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znrf3Q5SSZ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms