Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms