Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms