Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam46cQ5SSF7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam46cQ5SSF7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam46cQ5SSF7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam46cQ5SSF7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam46cQ5SSF7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam46cQ5SSF7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam46cQ5SSF7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam46cQ5SSF7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam46cQ5SSF7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam46cQ5SSF7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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