Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf12Q5SPL2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms