Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PkdccQ5RJI4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms