Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav6-2Q5R1I4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav6-2Q5R1I4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav6-2Q5R1I4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.1 ms