Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsrp1Q5NCR9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsrp1Q5NCR9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nsrp1Q5NCR9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nsrp1Q5NCR9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nsrp1Q5NCR9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nsrp1Q5NCR9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms