Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC57

Fam183b, Protein FAM183B, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam183bQ5NC57 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam183bQ5NC57 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms