Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trpm3Q5F4S9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms