Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG6

Hspb6, Heat shock protein beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb6Q5EBG6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hspb6Q5EBG6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hspb6Q5EBG6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms