Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrig2Q52KR2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig2Q52KR2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrig2Q52KR2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrig2Q52KR2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrig2Q52KR2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig2Q52KR2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig2Q52KR2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig2Q52KR2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig2Q52KR2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig2Q52KR2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig2Q52KR2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig2Q52KR2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig2Q52KR2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrig2Q52KR2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrig2Q52KR2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrig2Q52KR2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrig2Q52KR2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms