Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phactr4Q501J7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms