Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Foxn3Q499D0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms