Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms