Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9Q3V038 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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