Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms