Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc114Q3UX62 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms