Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E330034G19RikQ3UWX6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms