Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms