Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc190Q3URK1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms