Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brd9Q3UQU0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms