Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SbsponQ3UPR9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbsponQ3UPR9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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