Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cracr2aQ3UP38 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms