Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrc4Q3UP24 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms