Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem253Q3UNB8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms