Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMT1

Ppp1r12c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12cQ3UMT1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r12cQ3UMT1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r12cQ3UMT1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r12cQ3UMT1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r12cQ3UMT1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r12cQ3UMT1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r12cQ3UMT1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r12cQ3UMT1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r12cQ3UMT1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r12cQ3UMT1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r12cQ3UMT1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp1r12cQ3UMT1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms