Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM45

Ppp1r7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r7Q3UM45 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r7Q3UM45 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r7Q3UM45 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp1r7Q3UM45 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms