Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mccc2Q3ULD5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms