Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ell2Q3UKU1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms