Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc34Q3UI66 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms