Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tnrc6cQ3UHC0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms