Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc177Q3UHB8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms