Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms