Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Yipf3Q3UDR8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms