Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hectd3Q3U487 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms