Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Rnf40Q3U319 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Rnf40Q3U319 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Rnf40Q3U319 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Rnf40Q3U319 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Rnf40Q3U319 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Rnf40Q3U319 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Rnf40Q3U319 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Rnf40Q3U319 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf40Q3U319 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Rnf40Q3U319 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf40Q3U319 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Rnf40Q3U319 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf40Q3U319 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf40Q3U319 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf40Q3U319 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf40Q3U319 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf40Q3U319 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf40Q3U319 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf40Q3U319 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Rnf40Q3U319 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf40Q3U319 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf40Q3U319 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf40Q3U319 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rnf40Q3U319 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf40Q3U319 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf40Q3U319 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf40Q3U319 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf40Q3U319 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf40Q3U319 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf40Q3U319 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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