Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasip1Q3U0S6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasip1Q3U0S6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms