Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Hbq1bQ3U0A6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hbq1bQ3U0A6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Hbq1bQ3U0A6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Hbq1bQ3U0A6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Hbq1bQ3U0A6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Hbq1bQ3U0A6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Hbq1bQ3U0A6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Hbq1bQ3U0A6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Hbq1bQ3U0A6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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Hbq1bQ3U0A6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Hbq1bQ3U0A6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbq1bQ3U0A6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hbq1bQ3U0A6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms