Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pip4p1Q3TWL2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pip4p1Q3TWL2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pip4p1Q3TWL2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pip4p1Q3TWL2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pip4p1Q3TWL2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pip4p1Q3TWL2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pip4p1Q3TWL2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pip4p1Q3TWL2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pip4p1Q3TWL2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pip4p1Q3TWL2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pip4p1Q3TWL2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pip4p1Q3TWL2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pip4p1Q3TWL2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pip4p1Q3TWL2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pip4p1Q3TWL2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pip4p1Q3TWL2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms