Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3TTJ4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms