Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
D17Wsu92eQ3TT38 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms