Protein–RNA interactions for Protein: Q3TPQ7

AW146154, Expressed sequence AW146154, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW146154Q3TPQ7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AW146154Q3TPQ7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AW146154Q3TPQ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms