Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdnep1Q3TP92 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 952.1 ms