Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Smarca4Q3TKT4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Smarca4Q3TKT4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Smarca4Q3TKT4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms