Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fubp3Q3TIX6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fubp3Q3TIX6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fubp3Q3TIX6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fubp3Q3TIX6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fubp3Q3TIX6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms