Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc13Q3TIR1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc13Q3TIR1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc13Q3TIR1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc13Q3TIR1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc13Q3TIR1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc13Q3TIR1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc13Q3TIR1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc13Q3TIR1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc13Q3TIR1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc13Q3TIR1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc13Q3TIR1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc13Q3TIR1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc13Q3TIR1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc13Q3TIR1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms