Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RubcnlQ3TD16 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms