Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prr27Q3SYJ2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms