Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccbe1Q3MI99 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms